癫痫是一种累及神经系统的常见病、多发病、慢性病，治疗通常是一场持久战。一旦确诊癫痫，从开始服药起，一般至少需要连续服用3~5年。确诊癫痫需要可靠的病史、正规的脑电图检查及相关的病因学检查。
癫痫确诊后，使用抗癫痫药物进行治疗是最常见的选择。通常情况下，一旦确诊癫痫就需要开始正规的治疗，这是因为反复癫痫发作会进一步损伤人体器官功能，造成意外。如果癫痫发作极为稀疏，好几年才犯一次，诊断癫痫后可以不用药物治疗，但需要改变生活方式等非药物治疗，定期随诊、检查。另一方面，对患者来说，如果选择药物治疗，就意味着必须接受至少3~5年的规律服药，以及服药后可能出现的各种不良反应。
选择药物治疗需要考虑很多因素，必须采用个性化治疗方案，根据每个患者的具体情况来选择适宜的治疗方案。选药前需要考虑的相关因素有：性别、年龄、智力状况、体重、从事的工作、短期内有无怀孕打算、目前主要脏器的功能、药物导致严重不良反应的可能性、经济情况（要做好至少服药3~5年的打算）、是否适合手术治疗等等。药物治疗开始后，还需要定期随诊、检查，向医生反映癫痫发作控制情况，有无药物不良反应发生等等。
癫痫治疗的目标是完全终止发作或尽可能控制发作，避免出现严重不良反应，帮助患者回归正常的生活。经过一段时间的治疗，多数癫痫患者能够达到上述目标，少数患者可能在短时间内难以完全控制，甚至极少数患者用尽现有的方法仍不能彻底控制，这种情况医学上称为难治性癫痫。令人鼓舞的是随着研究的不断深入，新型药物和治疗方法不断出现，难治性癫痫会越来越少。
部分药物难治性癫痫患者，可以考虑手术治疗。
一般而言，目前用于临床的药物都经过了科学验证，大多数情况下是安全的，出现严重副反应的几率不大。实际上，大多数患者可以在没有明显的药物不良反应下，使病情得到较好的控制。
传统观点认为仅出现一次癫痫发作不诊断为癫痫，可以暂时不服药。但新的观点认为，虽然只有一次癫痫发作，但将来再次癫痫发作的可能性很高，这时医生会诊断癫痫，建议开始服用药物，以防止将来的发作。这些情况包括：神经系统检查发现明确异常、脑电图出现明显的癫痫样放电、脑CT或磁共振病变明确、亲属中有人患有癫痫等。另外，某些患者认为再次癫痫发作所导致的代价（如被迫辞职、意外受伤）大于长期服药的副作用时，或者认为服药后益处更多时，也可在一次癫痫发作后就开始服药。出现一次癫痫发作后，建议患者应及时就诊，由医生来评估再次癫痫发作的风险和服药风险，由患者和医生共同来决定是否开始用药。
抗癫痫药物开始治疗时的用药原则是单药治疗。对于大多数患者而言，使用一种合适的抗癫痫药物就能获得较好的效果。同时使用两种或两种以上药物（多药治疗）时，副作用可能增加，药物之间也可能相互影响，费用也会增加。联合多药治疗通常是在单药治疗失败后再考虑。
药物剂量的调整取决于服药后发作控制情况和有无明显副作用。如果发作控制满意，同时也没有明显的副作用，一般不需要调整剂量。反之，则可能需要调整剂量。每个患者的最佳药物剂量是不同的，最佳药物剂量是指既能控制癫痫发作，又无明显副作用的药物剂量，这也是每个医生追求的目标。这在临床实际工作中并不是轻而易举就能做到的，不仅需要医生的丰富经验、多次调整药物种类和剂量的尝试，还有患者及家属的密切配合，再加上一定的时间。
在规律服药但仍不能控制发作的情况下，患者首先应将服药后发作情况详细记录下来，在观察了足够长的时间后如发作仍无改善应及时复诊，医生会根据记录分析治疗失败的具体原因。如果不是诊断错误，而是药物剂量不够，则可能增加剂量后继续观察。如果不是剂量问题，医生可能考虑更换或者加用另外一种药物。如果仍然失败，则会进一步尝试其他不同作用机制的药物组合治疗。一般而言，如果使用2种抗癫痫药物单药治疗后仍难以控制发作，则提示该患者较难治，进一步使用其他药物完全控制发作的可能性较小。
癫痫是一种慢性病，需要长期治疗、随诊。什么时间可以停药，需要具体情况具体分析。通常情况下，如果患者一直没有发作，而且定期复查的脑电图也没有癫痫样放电，多数医生通常会建议在服药3~5年后考虑逐渐减停药物。
一些患者自行停药或加减剂量都不可取。如果因经济条件不好而停药暂时可以减少费用，但从长远来看患者常会付出发作失控的代价。对于经济条件不好的患者，建议开始服药前就告知医生，医生会根据患者的实际情况选择合适药物。有些患者在服用药物数天或数月后，没有发病，感觉病已经好了，就擅自减停药物；有些患者在发作较轻时自己减量药物，发作加重时再加量；还有些患者只在发作后才服药1~2次，平时根本不规律服药。这些都是错误的做法，药量不够或血中药物浓度波动太大均不能有效控制癫痫发作。患者应严格遵照医生的嘱咐，坚持每天按时规律服药最为重要。不要擅自停止服药或改变药物剂量，除非出现严重副作用等紧急情况。如果出现了忘服或漏服药物的情况，应如实告诉医生。如果出现药物副作用，应及时向医生反映。
医生在决定减停药物时，还常会结合患者具体的癫痫病因或癫痫综合征情况来考虑。例如，某些儿童良性癫痫综合征到一定年龄时发作就可自行停止，那时就没有必要继续长期服药。比如儿童良性部分性癫痫，癫痫发作常在青春期时自发缓解，因此医生多在患者青春期时就考虑减停药物了。相反。某些癫痫综合征，如青少年肌阵挛癫痫，停药后很容易复发，即使连续10年无发作再停药也很可能复发，因此该综合征患者可能需要长期甚至终生服药。目前还没有能预测停药后何时会复发的办法。
